¿Se acentúa el nombre de María en el latín eclesiástico?

Sí. Encontramos otros ejemplos como en el Cántico de los tres jóvenes (Cánticum tríum puerórum) de Dn3, 57-88 y 56-4

Bendecid al Señor, Ananías, Azarías y Misaël; alabadle y ensalzadle para siempre.